军权发动“九一四”政变，组成“专员委员会”，接管了卢蒙巴政权。
在随后登台的历届政府中，蒙博托牢牢地掌握着军权，一直担任国民军总司令。早在1961年1月，为了加强自己的政治基础，他重组了刚果军队，成立了刚果国民军。在美国、以色列和摩洛哥等国的帮助下，他又创建了刚果空军、伞兵部队。为了建立自己的伞兵部队，蒙博托还于1963年亲自来到以色列，接受了严格的跳伞训练。为了消除士兵的畏难情绪，他还带头在海上跳伞，这支部队终于建立起来。通过重组，他精心挑选了一批亲信，为自己日后夺取政权作好准备。
1961年1月18日，卢蒙巴被冲伯集团押到加丹加后加以杀害。随之而来的是分裂阴谋、篡权密谋、政府更迭、内乱、战争……
2月9日，一项具有宪法效力的法令结束了专员委员会的使命，伊里奥先生为首的临时政府得以成立。该政府保留了首届政府的7名成员，其中5名担任原职。伊里奥政府之所以是临时性政府，主要原因是部长们是在没有得到议会的授权下任命的。这种临时性还表现在政府的残缺不全上，一些部长的席位仍然空缺，主要是希望给那些尚未参加的省份。
这届政府的成立可以说是对蒙博托初次尝试夺权的一个打击。卢蒙巴的总理职位是蒙博托宣布撤销的；军事政变是由他发动的；专员委员会是由他组建的。但是，在1961年1月3日至7日为刚果问题召开的卡萨布兰卡会议上，与会国一致要求，必须采取行动，将“非法的蒙博托匪帮”解除武装。伊里奥政府由此而生。
1961年8月成立了阿杜拉政府，这是由国家元首发布任命并得到议会两院的一致通过。此时担任刚果国民军总司令的蒙博托已获得了合法的任命和合法的权力。占据了加丹加地区的冲伯集团力图进行分裂主义活动，给独立不久的刚果共和国构成了巨大的威胁。为了维护新生共和国的统一，刚果国民军于1961年9月21日分两路向加丹加发动进攻。基伍一路由阿杜拉将军负责，而开赛一路则由蒙博托将军指挥。
1964年6月30日，阿杜拉政府在经历了加丹加分离危机、缪勒尔叛乱、刚果的国际地位、与联合国的关系以及宪法、财政等问题的不断困扰后，不得不在执政35个月后郑重地提出了辞职。莫伊兹·冲伯受托进行组阁工作。冲伯政权仅维持了15个月。约瑟夫·卡萨武布总统在罢免了冲伯后，任命埃瓦里斯待·坎巴组阁。
然而，埃瓦里斯特·坎巴在1965年11月14日未能获得议会的信任投票。卡萨武布总统再次委托坎巴组阁。此时，国内政局已十分混乱，谣言四起，人们传说有人正在进行阴谋篡权活动。真可谓“山雨欲来风满楼”。
此时的蒙博托已是今非昔比。1961年的军队改组使他得以在军中培植起一批得力助手；对加丹加分裂集团的进攻大大提高了他在国内和国际的威望。5年来的官宦经历使他对一些官场把戏和政治手腕更为娴熟。同时，其他各政治集团在几年的流血或不流血的争斗中已是损兵折将。惟有他在养精蓄锐，待机崛起。
更重要的是，对国家独立充满着美好憧憬的刚果人民在经历了数年的分裂战乱后，其忍耐力已变得十分有限。他们本来希望在摆脱殖民主义的枷锁以后，能过上和平安宁的生活。然而，残酷的现实把他们的希望击得粉碎。在独立后的5年时间里，5O多万人死于战乱，数十万人流离失所，刚果民族英雄卢蒙巴惨遭杀害，以联合国军队为旗号的外国军队又出现在利奥波德维尔的大街上，加丹加的战火，政权如走马灯似地更迭，政客们争权夺利，毫不相让……够了，他们受够了！
刚果在呼唤一个能人出来收拾局面。
1965年11月24日。利奥波德维尔。
电台里传来了刚果国民军总司令约瑟夫·德西雷·蒙博托低沉的声音：
“我宣布：刚果从此将结束内战，实现和平。我们将建立起一个稳定的政权。”
饱受磨难的刚果人民以平静的心态接受了这一政局的变化。虽然他们希望和平，虽然他们盼望安定，但政治家的许诺他们已听到过许多许多，谁又能保证这些许诺有朝一日不会像光怪陆离的肥皂泡一样破碎呢？
蒙博托借助军队顺利地夺取了政权。他废黜了约瑟夫·卡萨武布总统，并宣布取消埃瓦里斯特·坎巴组阁的任务。随后，蒙博托将军又任命了他的亲信穆朗巴上校为刚果（利）共和国总理。
利奥波德维尔相对平静。
人们在静心地等待。
11月25日；莫伊兹·冲伯表态：他对新政府表示支持。
11月26日，埃瓦里斯特·坎巴公开表态；全力支持新政府。
同一天，刚果共和国两院议员通过了参议院议长（他同时兼任两院联席会议议长）门丹盖宣读的决定：
——1965年11月24日刚果共和国成立非常时期的政府；
——蒙博托将军行使共和国总统的宪法权力；