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以前，马科斯曾经说他找到了山下奉文藏金，价值22O亿美元。有人说，马科斯出逃前已将这笔黄金转移到国外，分别贮藏在香港，伦敦、新加坡、美国、瑞士、巴拿马以及荷属安的列斯。如果确有此事，菲律宾政府就可以追缴这笔巨款。
经过3年的调查，委员会初步查清马科斯家族的财产有：
在菲律宾，房地产4500亩，土地5000亩，农场23处，公司232家，椰子油工厂10家，电视台18家，广播电台36家，飞机29架，游艇13艘，现金10亿美元，珠宝折价1O亿美元，黄金数吨。
在美国，有纽约曼哈顿区的4栋办公大楼，洛杉矶贝佛利别墅，夏威夷檀香别墅，纽约长岛房地产，纽约第五街3套公寓，现金和珠宝7亿美元。
在瑞士银行，存款1O亿美元，有估计为3O～5O亿美元。一位在欧洲从事银行业务的菲律宾银行家在1989年7月向菲律宾国会作证时说，他已查明：“马科斯在瑞士有一笔75亿美元的存款。”
在澳大利亚，有5亿多美元。
在巴西，至少有3亿美元。
初步查明的马科斯家产就已让人触目惊心了，更何况还有许多尚不为人所知的资产。菲律宾政府迅速采取了行动。在菲律宾，被确认为属于马科斯的财产及股票被冻结。
菲律宾政府清查马科斯家族财产的行动，得到了一些外国政府的积极支持。
1986年3月，美国将马科斯随身行李的海关造册，一份长达2300页的资产清单交给了菲律宾政府，这批钱物成了马科斯鲸吞公款的证据。
1986年6月，菲律宾政府向洛杉矶法院提出一项国事诉讼，想收回被马科斯夫妇从菲律宾掠走的5O亿美元。美地方法官玛丽安娜·普法泽宣布，在作出判决之前，将冻结马科斯在世界各地的资产。
1987年11月27日，马科斯夫妇以其轰动世界的丑行被美国一家杂志评为特别荣誉“终身成就”奖，让他们臭名远扬、狼狈不堪。
1988年1O月21日，美国纽约联邦法院又突然起诉马科斯，罪名是敲诈。大陪审团指控马科斯在总统任期内，挪用公款1．O3亿美元，并从美国银行诈骗了1．65亿美元。
1989年12月18日，洛杉矶一家联邦法院法官规定了伊梅尔达的开支限制：伊梅尔达必须得到法院的批准，才能支出超过1万美元的费用，但是支付律师费和法庭费用除外。她必须报告任何超过1万美元的借款．必须每月向法庭汇报详细列出的所有借款或礼物支出账目。
瑞士有关当局于1986年3月应菲律宾政府的要求冻结了马科斯在瑞士银行的存款。1995年8月，苏黎世州立银行就马科斯在瑞士存款一案作出裁决；瑞士银行应将马科斯存在瑞士的约5亿美元存款转移到菲律宾的一个账户上，由菲律宾法院裁决其归属。
追讨马科斯在世界各地的巨额财产是一项艰巨的工作，菲律宾政府不得不踏上旷日持久的追讨之路。
与此同时，马科斯家族统治的不少丑行开始被揭露出来。其中最具影响的即是重新调查阿基诺被刺事件。
马科斯出逃一个星期后，菲律宾政府组成的人权委员会提出建议；重新审理阿基诺谋杀案。
1986年6月6日，菲律宾成立了一个以最高法院前法官康拉多·瓦斯克斯为首的3人特别委员会，重新审理阿基诺一加尔曼双重谋杀案。这个委员会经过45天的特别调查之后，于7月31日宣布，菲律宾反贪法院过去对涉嫌的前武装部队参谋长维尔和其他25名嫌疑犯作出的无罪判决无效。9月16日，反贪法院下令逮捕谋杀阿基诺的全部26名被告。
1987年8月19日，菲律宾反贪法院重新开庭审理阿基诺被谋杀案。
这次审理不久即取得了重要证据：
第一、图片证据。阿基诺遇害几小时之后，阿基诺的遗体被还给了他的亲人。菲律宾职业摄影师亚历山大、洛伊纳斯应被害人亲属及反对党领导人的请求，在阿基诺遇害几小时后拍摄了他的尸体剂检照片。
在这次案件审理中．他当庭出示了39张大照片和4O张幻灯片。这些照片显示，枪杀阿基诺的子弹是从阿基诺背后射入的，子弹穿过地的头部后从下巴出来。
这些证据表明邓可基诺是在走下飞机时，被人从他身后高处开枪杀害的。而当时站在阿基诺身后的都是士兵。
菲律宾首席检查官劳尔·冈萨雷斯说，洛伊纳斯提供的照片实际上推翻了以前的说法，即子弹的走向是由下经上，碰到骨头后才改为向下的。
第二是找到了重要的人证。
1988年1月4日，马巴拉特别法庭举行听证会。马尼拉国际机场地勤工人巴塞罗纳在7名保安人员监护下出庭作证：1983年8月21日，他驾驶一辆拖车在马巴拉机场停机坪上，看见阿基诺与3名警卫从客机上下来。他说：“我看见穿白衣服的人（阿基诺身后的一名士兵）用