军派出一支部队从巾口南渡，进攻夏首勋军阵地，激战几天，双方伤亡都很严重。王陵基又派韩全朴军接替夏首勋军。日军观察到守军换防，兵力空虚，命令第三十六旅团停止反攻，配上战车，转向箬溪东南渡过修水，进攻靖安方面韩全朴军侧翼范楠宣师的阵地。守军第一团沉稳抵抗，用集束手榴弹摧毁两辆日军战车，挡住了日军的混合大队。
28日，日军第三十六旅团再次用观测气球指挥炮兵轰炸范楠宣师阵地，第一团阵地全毁，韩全朴与范楠宣率领特务连上火线督战。日军用强烈炮火阻止守军预备队的调动。这时，南昌失陷的消息传来，影响了守军士气。当晚，范楠宣师苦战不支，范楠宣率部突围，靖安失陷。日军稻叶师团主力立即穿过缺口，从侧翼向武宁进攻。第二天凌晨，日军攻占了武宁。
但是，王陵基集团军的防线并未崩溃，日军只在武宁形成一个突出部，与守军对峙。
4月上旬，国民政府军事委员会命令罗卓英统一指挥第三战区和第九战区各一部共约十个师，反攻南昌。方针是：“先以主力进攻南浔沿线之敌，确实断敌联络，再以一部直取南昌。”
21日，反攻开始。第九战区卢汉集团军第一八四师和新编第十师向奉新日军发起攻击；第十一师主力监视靖安日军，一部向滩溪挺进。到24日，日军退守奉新。俞济时军主力攻击高安附近的日军；俞济时军和刘多荃军各一部北渡锦江，攻击大城和生米街一带的日军，到26日，收复了高安、大城和生米街，并一度攻入牛行，日军退守高安东北一线。此后，第九战区部队进展困难，无力切断南浔线。
第三战区上官云相的第三十二集团军，派第十六师、第七十九师、预备第五师和预备第十师一部，于23日渡过抚河，向南昌方向攻击，26日收复南昌东南市汊街，迫近南昌。27日，日军斋藤师团得到海军陆战队支援，进行反扑。上官云相集团军攻击受阻，派第二十六师加入战斗。5月5日，攻克南昌东侧的飞机场及南昌火车站。7日，南昌日军与前来增援的中井师团，在航空兵配合下，不断反击。上官云相集团军伤亡很大，所属第二十九军军长陈安宝中将殉国，攻击受挫。9日，中国军队奉令停止反攻。
南昌会战经历了一个半月时间，以中国军队失利而告终。这次会战，共歼灭日军五万多人，中国军队伤亡近十万人。