完全试验成功，如来等都是大为振奋，只要到时依法而为，就可以了。
但是，事情这时却又有了新的变化。这一天，女娲将伏羲和如来召集到一起，孙悟空却被支开了，伏羲和如来均感奇怪，到听完女娲所说之事，都吓呆了，伏羲真不敢相信，自己妹妹竟然会作出这样的决定，如来则暗暗叹息，只因这件事恐怕也只能这么做了。
第二天，女娲召开全体会议，宣布了一项指令：所有仙神，除被指定的以外，都要立即离开天界！此令一出，天界立即便炸了锅，没有被指定留下的仙神，都认为这是领导层要放弃下层，自己以方舟逃命，于是一些脾气较为暴燥的仙神便带头要闹事，其余仙神为了活命，便纷纷加入，转瞬间，凌宵殿便被暴动的仙神包围了起来。
眼看群情汹涌，女娲仍是不慌不忙，继续解释道：“我们并不是为了要抛下你们逃命，而是~~”但众仙神已不肯听任何解释，女娲的话还没有说出来，立即便被打断，一些难听的话纷纷传出，说女娲是为了要和孙悟空双宿双飞云云，这一下立即令孙悟空怒火中烧，自防护服腰间取出如意棒，（两者皆是以当日诞下孙悟空的‘蛋壳’制成，防护服本身可隔热，而且可以自动将穿着者身体的能量在外层实质化，形成更强的保护层，当然是以孙悟空穿着最为合适，如意棒则是能将星之心的能量高度集中起来向外发射，这两件装备本来是为了让孙悟空取代久星之心时更安全、更迅速地成功而准备的。）力量一灌注下，如意棒两端各射出一道黄金光柱，孙悟空将如意棒一挥，喝道：“你们这些贪生怕死的家伙！是不是嫌上次受的教训少了？要我再动一次手吗？”
上次孙悟空变成黄金巨猿，受女娲影响刚开始恢复理智的时候，就曾经为了有仙神想趁机偷取神器中的能量而暴怒大闹，虽然当时没有造成伤亡，却因此毁了大半个天界，众仙神哪个不惧？这时的孙悟空虽然没有变身成最终形态，只是一般的倒立金发形态，但仍是威风凛凛，令众神不敢再胡闹，紧接着女娲说：“我们并非是要逃走，证据就是~~”说着向伏羲打了一个手势，伏羲在玉座上按下几个键，天界立即一阵的摇晃，靠近外沿的仙神回头一看，那仍空无一人的方舟竟已开始升空！
众仙神一见如此景象，都是大惊失色，这一边女娲随即下令道：“悟空！动手！”孙悟空猛然喝道：“你们就乖乖地到下界去吧！”同时黄金气团增强十倍数计，手上如意棒射出的光柱粗逾过尺，挥舞着便向众仙神扑去！
不消一会儿，除了女娲、如来、伏羲及原本就指定留下来的神农、无方龙王、昆仑圣外，众神尽被孙悟空轰出了天界。孙悟空回到凌宵殿中，只见琴鼎印镜石五件神器已摆放好，正要进行最后的步骤：将元神注入。神农等将元神贯注入神器后，最后还有两件神器，只见伏羲和女娲各取起琴和石，孙悟空见状吓了一跳：“什么？怎么连~~连你都要牺牲元神吗？”女娲凄然摇了摇头，说：“我跟他们不一样，这神石，只要我注入力量，就可以拥有意志，不过，哥哥，再见了！”伏羲最后看了女娲和孙悟空一眼，说：“那么，哥哥去了！”
五阴五阳的十神器终于全都完成了，女娲替神石注入力量，自己则变得相对虚弱，孙悟空连忙上前，要为女娲补充能量，却被女娲阻止：“不，悟空，不要再浪费能量了，因为我们马上就要进行‘补天’计划了，等计划完成后，再慢慢补充不迟呀。”孙悟空因为对先前的会议毫不知情，这时也感到惊讶：“啊？马上就要进行‘补天’？”如来解释道：“是呀，娘娘前几天在和星之心的沟通中，发现地磁场已经非常地不稳定，所以，我们认为行动的时候到了。”孙悟空这才恍然大悟：“原来是因为这个呀，我还以为将那些家伙赶走，只是为了防止他们打神器的主意呢。”
女娲轻轻一笑：“有你在，他们有这个心也办不到呀！担心什么？现在你就给神器都注满能量，进行布阵吧，这是个很重要的任务，所以一定要集中精神呀！”孙悟空应一声“好！”便开始将能量提升起来，十件神器随即围绕着他飞舞起来，不断地吸取能量，孙悟空全神贯注下，不知不觉间竟沉沉的睡着了。
如来上前接祝猴悟空，对女娲水：“娘娘，他睡着了。”女娲点点头，对着伏羲琴说：“哥哥，谢谢你帮忙了！”跟着自怀中取出另一块和神器女娲石一模一样的石头，走向阵中，最后回过头来再看了孙悟空一眼，说了一句：“悟空哥，我等你，一生一世！”
原来因为孙悟空和原来星之心属性不一样，虽然可以为神器充满能量，却不能作为主阵的核心，女娲最后决定牺牲自己，以全身能量及元神注入到另一块女娲石中，炼成圣灵珠作为主阵核心，但因为怕孙悟空会反对，所以瞒着他，跟如来和伏羲商议，最后伏羲答应了女娲的请求，以阴阵催眠了孙悟空，还将孙悟空的思想和记忆封存在泥丸宫中，如来则负责将孙悟空安置到航行器中，并输入资料，以备他日孙悟空醒来后使用。
如来看着女娲渐渐消失，心头一阵感触，明白到为什么女娲不欲孙悟空亲见此境，伸手在孙悟空额头