此放弃研究工作。1886年，他与玛莎-柏奈丝为妻，这段婚姻虽给佛洛依德造成了许多痛苦，但他因此有机会从自己孩子身上，研究所谓的“儿童性诱惑”。这同时，那时他也学着从自己身上找答案，因为当时几乎没有人会告诉他真话。他回想自己小时候偶而看到母亲换衣服时，内心的性激奋。他确信那些女病人记得童年性诱惑是“幻想”并非“谎言” ，由此获得“儿童也有性欲感觉”的惊人结论，这个结论彻底推翻“儿童是天真无邪的”这种人人共鸣的说法，可想而知，当时佛洛依德受到社会人们多大的攻击。其实一开始，佛洛依德也很抗拒这个结论，但他一旦接受了自己的理论，就再也不顾社会压力继续研究下去。
佛洛依德还指出，人类所做的事如果不是为了“保护自己”，就是为了“享乐”，而这些追求享乐的活动，广义来说，都跟性欲有关。佛洛依德把这种性欲的原动力称为“力比多”，他指出如果性欲动力受社会世俗限制，无法直接表达，就会寻找其他途径发泄，幸运的话这股动力会转到有创造性的活动上“升华”；要不然，就会侵扰心理和生理，出现种种身心症状。
佛洛依德强调“性”对人格的重要性，当时成为心理研究一次翻天覆地的革命。从此临床治疗和精神分析多少都脱离不了这个范畴。虽然西方社会曾被佛洛依德坦率的研究惊吓到，但即使最反对的人士也不得不承认，佛洛依德为后世开启了一扇观心的法门。