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而且，现在斯大林考虑的已不是入疆苏军被消灭的问题，而是为苏军入疆作战把人民军完全给推到了苏联的对立面、为今后新疆出现一个对苏联充满敌意的势力而头疼。况且，人民军既然能一战歼灭新疆境内包括入疆苏军在内的几万兵力，其实力已不可轻视，也足以引起莫斯科的高度警惕。
斯大林知道李维诺夫这一段时间把注意力放在欧洲和东亚方向，特别是德国和日本身上，新疆方向出现疏漏也在所难免。要说负责的话，也是中亚军区的责任更大。入疆精锐被敌人消灭至今却没见到中亚军区有任何情况上报，还是苏军情报局发觉塔城方向有异动而于2月9日一早演讲莫斯科的。不过，也仅比李维诺夫早了一天而已。
“情况我已经知道了。外交人民委员会应就领事馆和外交人员、我国侨民生命财产安全一事发表声明，表明我国立场。态度一定要坚定，必要时，为了维护国家尊严，我们不惜出兵新疆。”斯大林吐了一口烟雾，又沉着脸告诫道，“外交方面的不足要尽快弥补，对德国、日本，以及欧美其他国家的工作决不能出现新疆那样的失误”
虽然无法就入疆苏军被歼灭一事向人民军发难，可若人民军在苏联驻新领事馆和侨民上有令人指责的地方，斯大林也不介意趁机出兵新疆，把人民军这一潜在的要挟尽早消灭。再说，只需用心，借口总是有的。一股对苏联充满敌意的势力，还是在其未兴起之前就消灭得好。斯大林心里已动了要把人民军早日除掉的念头。
一边战战兢兢的李维诺夫听了斯大林的话后，明白自己此番算是过了关，心中的一块石头才算落了地。他连忙表态道：“声明明天一早就见报。保证今后不再出现类似失误”
斯大林点点头，然后示意李维诺夫能够离开了。
到2月10日晚，也就是北进集团出击蒙古并已基本达成战役目的的时候，西进集团指挥下的九纵也分东、西两路完成了挺进南疆的作战任务，控制了新疆通向外界的吐尔尕特山口、乌孜别里山口、喀喇昆仑山口等一众要隘。
在1月29日反击作战开始后，九纵纵队长王凤山就和参谋长鲁学义率领主力由轮台出发，沿西线向库车、阿克苏、巴楚、疏勒等地挺进；而副纵队长吴迪则带领3个团近万兵力由库尔勒出发，沿东线向尉犁、若羌、且末、于阗、策勒、和田等地进发。
从距离上看，西线由轮台到疏勒的距离有840公里左右，东线由库尔勒到和田的距离有1300多公里。无论哪一线都远超北进集团挺进北疆、蒙古的距离。
路程虽远，但九纵挺进南疆的难度却远远小于北进集团出击北疆和蒙古西部。其原因有二：
一是东西两线都有现成的道路可用，而且都是从丝绸之路开辟后通行上千年的通道。虽然还不足以通行重载快速汽车，但通行胶轮马车和3吨载重汽车慢行还是没问题的。
二是南疆气候远不象北疆和蒙古西部那样寒冷。由于有天山阻挡，南疆的气温要比北疆高出一大截。象库尔勒和轮台一带，2月份多年平均气温在零下2度多点，即便夜间最低温度也只是零下10度左右。这样的天气，夜间行军是完全没问题的。
实际上，若非九纵东、西两路采取了“夜间行进、白日平定、抵达一处、稳定一处”的行军方案，西线从轮台到疏勒840公里、东线由库尔勒到和田1300多公里的路程根本就不用了到2月9日晚才抵达。
夜间行进除了是避免过早暴露人民军进入南疆的消息外，也是为了出其不意打击那些五花八门的分裂势力。在利用夜间开进到某一地域后，九纵就凭仗兵力和机动优势拉起封锁线，许进不许出，等天亮后再逐一清理封锁线内的各种反对势力。
敢于顽抗的一律就地处决，其他抓获的分裂势力分子将被送去服劳役，处置修建道路、采矿、构筑工事等重体力劳作。
人民军后面还要面对来自苏联的强大压力，自然不允许控制区内还留存着各种分裂势力。况且，这些分裂分子里，大多是白俄残余和极端宗教势力，对新疆当局乃至中国根本就谈不上什么认同感，想的只是利用外国扶持，在新疆这个地方裂土建国。针对这种情况，当初赵振中制定完新蒙作战计划后，曾特地把即将出任九纵主官的王凤山、吴迪等人找来面授机宜，明确要求：“出击南疆决不能手软，一定要杀出至少10年以上的太平来”
2月11日，吴迪所率领的东线部队已经从和田赶到了蒲犁，同王凤山率领的九纵主力在这里会师。至此，新疆东、西两线所辐射到的通向外界的各个山口也全被人民军所控制。
“老王，我这一路上就没碰到什么硬茬子，都是些小鱼小虾。除了让新兵见了血外，根本就没啥收获。你这边怎样？”一见到王凤山，吴迪就忍不住问道。
王凤山看看眼前由东、西两线抵达这里的部队，指导着说道：“我看这部队明显比出发时多了几分硬气，收获还是有的。”
虽然没有经历大的作战行动，但九纵沿途对五花八门分裂分子的清理却使纵队