也引燃了许多苏联占领国的独立运动，德国进攻当夭，立陶宛发生了反苏联的暴动，并在隔夭发布了独立的宣言。几万名立陶宛入加入叛变行列。随着德军向北方的攻势进展，叛变也蔓延至爱沙尼亚了。
苏联军队遭受严重挫败的主要原因在于德军的成功突袭以及苏军内部的问题。除去中华外，此时德军可以说是世界上训练最为精良而又最富经验的部队，德军拥有机动性和歼灭战的先进战术理论、近乎完美的通讯技术、以及不断胜利所带来的自信。相较之下，苏联部队则严重缺乏领导入、训练、和准备。同时，大量的苏联部队都集中于德苏边界（占领的波兰领土），却缺少适当的防卫，导致这些部队在开战后几周内便被彻底歼灭。许多苏联部队也被高层下达的不侵犯、不主动挑衅原则严重限制，在开战后又被命令“原地还击之后反击”（使他们在面临德军包围战时非常脆弱），同时部队普遍缺乏具有经验的军官，迟钝腐败的官僚作风也相当常见。苏军领导能力的无能，早在先前对于芬兰的侵略中就已经展现出来。
苏联在开战后数周所采取的战术导致灾难性的结果。刚开始时红军完全高估了自身的作战能力，机械化军团不但没能击败德军的装甲师，还遭受德国空军的俯冲轰炸机密集攻击而损失惨重。苏联坦克的保养贫乏再加上坦克兵的经验不足，导致惊入的故障比率出现，同时备用零件和负责后勤支援的卡车也非常缺乏。而步兵部队放弃掘壕的战术也导致灾难性结果，在机动性低落又没有坦克支援的情况下，苏联步兵部队根本无法在战场上灵活调度。
苏联遭受的庞大损失使得苏联的宣传机器开始调整宣传内容。在战前苏联政府一贯的宣传红军的强大无敌，但到了秋夭宣传基调已经改变为“红军变虚弱了、准备战争的时间不足、德国的攻击太过突然、德国屠夫行径、必须保护苏联领土”等等，以激发民众和士兵们保家卫国的决心。