掌握在自己手中。不是他不相信眼前这些人，而是害怕以后自己的队伍扩大之后，人员良莠不齐，到时候没有政党的约束很难控制，所以他必须要未雨绸缪。
另外，非常方便的，李明便照搬了当年共产党的所有做法，让所有部门的领导者都成了医神教的头领，实行了党员负责制，同时，在军队各级中设立政治委员，用以制约领兵的大将，甚至连一个小队中都要有一个医神教的头目，用以监视领导自己小队的队员。
然后，李明将岛上的军政大权分开，圣手王专门负责军队的管理和领导，李明将之称为统帅部，圣手王被封为统帅部主席。本来李明是想要自己的老岳父来干的，毕竟张猛在军中的威望是无可比拟的，但是，虽然现在他和尉迟雄两个人正在为自己训练新兵，可自己的理想抱负和计划都没有对他们说过，他们到底是朝廷中领兵多年的将领，如果知道自己要造反的话不知道会是什么反应，假如到时候他们都反对自己的做法，那他就非常难办了。因此，李明就将这个重担交给了圣手王，而只是任命张猛和尉迟雄为统帅部的总教练，专门负责部队的训练工作，这样也是物尽其用了，不过，真要是到了战争的时候，他们是领兵作战的绝对首选，到了那个时候，恐怕也只有连蒙带骗了。
军队的编制还是按照这个朝代传统的方式来进行，毕竟这是一个冷兵器的时代，自己那个时代的三三制并不适合这里。大规模军团作战的话，还是需要一个好的、严密的阵型。不过，李明还是借鉴了现代军队中的军衔制，虽然这个朝代也有类似军衔的东西，那就是将阶，但是，他们的将阶分得非常复杂，一共有四十五级之多，所以，李明废弃了传统的将阶，而用现代的军衔取而代之。他将军衔分为九级，分别是尉、校、将和元帅，并且将现代军事管理中军衔和职务的关系引申到队伍中去。
至于行政方面，当然要交给高韦了，他可绝对是不二的人选，这种最让李明头痛的工作到了高韦手中简直是轻而易举的事情，所以，李明当然放心了。行政方面还是称为总理署，高韦出任总理大臣。下属农业部、治安部、财政部、和杂务部，具体的部长人选就全部交给高韦了，对于他李明是绝对信任的。
工业方面，李明单独交给了陈浩，虽然以前是一个马车夫，但是自从进入碧泉岛之后他就一直担任领导工作，是一个非常能干的多面手，目前来说还没有人能够取代他，所以，李明当然就交给他了。好在现在碧泉岛的产品都是垄断性的，倒不害怕有什么市场竞争之类的，目前主要做的就是抓好生产、做好保密工作，以防止商业秘密的泄漏。
除了这三个主要的部门，李明还特意设立了安全局，由一直负责侍卫工作的马林来负责，主要负责反贪、监察、情报、暗杀等活动，独立于其他部门之外，直接向李明负责，甚至有直接调查圣手王、高韦和陈浩的权利，权利非常大。由于涉及面很广，工作量也非常多，所以人员方面就主要是马林的那些剩下的侍卫了，虽然一部分被高韦要走了，不过剩下的也不少，虽然一时之间还不能适应，但总归是聊胜于无。而日后人员的配备问题，就只有慢慢的来了。
财政总局由小翠负责，负责所有部门财物的监管和调配，这个小丫头总算是非常努力，目前已经是李明的左膀右臂了。
林珑和张瑶成了碧泉岛的行政总监，负责监管所有官员，平时李明不在的时候负责接替李明的职位。
司徒言，这位临滨城的名医，被李明任命为教育局的局长，独立于其他部门之外，直接归行政总监管理。从现代社会过来的李明当然知道教育的重要性，这一代人的思想观念基本上就固定了，今后社会的发展、新观念新思想的传播都要靠他们的下一代了，所以，单独将教育独立出来也是希望司徒言能够在最短的时间内位碧泉岛日后的发展尽快的培训出自己的人才。当然了，在此之前岛上已经有了不少的学校，而且全部都是免费的，不过由于李明和圣手王太忙，一直没有时间去具体的过问此事，现在，李明单独交给了司徒言，这样就可以按照自己制定的教育方法和教材对学员们进行有针对性的教育和培训了。
林珑训练的那批难民，则成了李明的直属卫队，归李明直接指挥，虽然不知道这批人的实力究竟怎么样，但是看到林珑那充满自信的样子，他还是放下了怀疑的心态，毕竟林珑不会害他的，而且让林珑都这么满意的话，那他们的真正实力就很令人期待了。
洋洋洒洒的讲了一个上午，李明将这碧泉岛上第二次重大的体制改革宣布完毕，然后，他又详细地解释了每个部门的具体职责，最后，拿出他经过这一段时间内地思考，并在昨天晚上整理打印出来的文件分发给了每个部门的负责人。知道他们一时接受不了这么大的变化，所以李明将具体的规章制度和法律法规都规定出来了，到时候他们只要照章执行就可以了，这么做虽然有些独裁和武断，但目前来说也只有这样了。
就这样，这场会议一直进行了两天，在这两天时间内，李明同各部门的负责人详细的谈论一些具体的细节，虽然李明以前在那个