答“物质的运动变化过程是不是物质？一个事物变化了，那么这个事物是原来的事物，还是成为了一个新事物呢？”。现在我们可以回答：物质就是能量周期性的变化过程，精神是对物质变化过程的“反应”过程。物质和精神都是形式，物质是对形式静态的表述，精神是对形式动态的表述。运动变化之后是否变成了新的物质或事物取决于运动变化是否能引起注意系统的改变。对于生命系统来说，在“观测机制”之上还存在一个“行为机制”，即从认识到采取行动的过程。人们通常所说的意识就是对“观测机制”的注意。意识不仅仅是一种机制，也是一种行为。
整个世界存在是不确定性的，但是具体事物存在有确定性。在这一原则中，物质世界和客观世界是必然和有规律的，精神世界和主观世界则是偶然和自由的。物质作为精神的基础，客观作为主观的限制，但是物质无法决定精神的发展，客观也不能决定主观将如何变化。采取的行动会引起“观测机制”的某些改变，这种改变即是精神作用到物质的过程，也是主观改变客观的过程。同时，“观测机制”的存在也反映了，生命系统在变化和被改变着。“为什么改变”取决于主观目的，“如何改变”取决于对客观情况，能在多大程度上改变则取决于系统能量。生命的过程就是一个选择改变的过程。当生命的所作出的选择到最后导致生命不能在做出任何的选择时就是生命过程的终结，生命就消亡了。
生命的过程就是一个选择改变的过程。所谓的“自我”也是正是在选择的意义上来标识的。不论是“自我”的个体，还是“自我”的后代、家庭、民族、种族、国家等都是在基于相同的“选择”上进行标识的。这些选择有基因的选择、行为的选择、信仰的选择、生活方式的选择等。保持“自我”即是作出相同的选择，改变“自我”即是做出不同的选择，Zloker01的最终目的之一也是由无意识到产生自我的演算过程。
但是，做出一个选择可能会带来更多的选择，也可能会导致无法作出更多的选择。面对不确定的世界，无法保证所作出的选择不会导致生命过程的终结。生命个体的死亡，就是选择的错误导致选择过程的终结。所以，发展出尽可能多的个体，拥有尽可能更多的选择是生命存在的本性。自由就是对可能的选择，对自由的追求是生命的本性。要追求更多的自由需要突破物质和客观世界的限制，扩大精神和主观世界，这也是为什么生命系统总在寻求发展和扩张。而理性的发展就是现在的发展能带来将来更多的发展选择，而非理性的发展就是现在的发展会导致将来无法再发展。扩大精神和主观世界的过程就是包容物质和客观世界的过程，也是认识、改造物质和客观世界的过程。在这一过程中，哲学要解决的是“怎样去认识和改造”的问题，科学需要解决的是“采取什么方法可以达到确定的认识和改造目的”的问题。
关于Zloker01的解析先回到原始的二维模型。
1、图灵机
所谓的图灵机就是指一个抽象的机器，它有一条无限长的纸带，纸带分成了一个一个的小方格，每个方格有不同的颜色。有一个机器头在纸带上移来移去。机器头有一组内部状态，还有一些固定的程序。在每个时刻，机器头都要从当前纸带上读入一个方格信息，然后结合自己的内部状态查找程序表，根据程序输出信息到纸带方格上，并转换自己的内部状态，然后进行移动。这是一个具有两个方格颜色、三个内部状态（分别对应了三种不同的箭头角度）的图灵机。第一条规则表示如果机器头当前读入的方格是黑色的，且内部状态为1，那么机器头就把黑色擦去，并且右移一格，内部状态由1转成2……
传统的计算机科学将图灵机视为一种计算的工具，即给图灵机编写适当的规则表让它完成某种计算任务，例如计算1+3。但是在ANewKindofScience中，我们关心的不再是计算任务，而就是观察当给定一组规则后，程序如何行为。也就是说，仅仅关心图灵机在一维纸带上写出的图形。因此，不同的程序在相同的纸带上经过多步计算能够形成非常不同的图形。
在ANewKindofScience中，我们可以把不同时刻的纸带像一维细胞自动机一样排在一起形成一个二维的世界。而机器头可以用一个黑点表示，小黑箭头就是图灵机的读写头，它会在纸带上移来移去画出漂亮的折线。机器头的不同状态对应这个小黑箭头的不同朝向，而机器头遵循的规则就对应了一组图标。因此，给定简单的规则，放手让程序演化，这就是ANewKindofScience研究计算宇宙的方法。
2、替代系统（Substitutionsystems）
另外一种计算机科学中常用的计算模型就是抽象的重写规则系统，例如，重写规则：A－－>AB，B－－>BA。从一个字符串开始经过反复重写，可以得到非常复杂的字符串。N变化不同的重写规则能够得到不同的Pattern，ANewKindofScience的研究方法仍然是将不同步骤得