朝会过后，内阁大臣回到值房，立即召开了闭门会议。其实在朝廷在远征吕宋之前，就已经考虑到今后如何治理吕宋的问题，不过在一些问题上，内阁出现的一些分歧，才拖延了下来。
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不过如今又出现了一丝变数，那就是郑芝龙的问题再度凸显出来。如今是郑芝龙的舰队在把持这吕宋的防务，朝廷不可能部队郑芝龙有所防范，毕竟郑芝龙十亿个有不光彩过去的朝廷重要将领。
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所以朝廷要尽快的派遣官员到吕宋去任职，在郑芝龙之前，把吕宋牢牢的控制在朝廷的手中，这成了朝廷的当务之急。于是内阁赶紧召开闭门会议，官员问题一定要尽快解决，否则后果就严重了。
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就派遣谁就任吕宋总督，内阁大部分的大佬们都觉得杨一鹏这个人不错，有能力，有肯干，而且还知兵事（杨一鹏成都任职时，当时播州（今贵州遵义一代）出现动乱，杨一鹏没有动用一兵一卒就有平息动乱）于是众大佬就内定杨一鹏为吕宋总督。
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但是问题就出在杨一鹏现在是漕运总督，如果要是把杨一鹏调任吕宋的话，漕运总督这一重要职位就空出来了，那让谁来接任漕运总督，是一根让人十分头痛的问题。想当初在在杨一鹏就任漕运总督这一事上，朝廷就闹得沸沸扬扬，现在，这一职位又出现空缺，朝廷里面不整的头破血流才怪。
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正是因为漕运总督的接任人选众大佬不能取得一致的意见，所以这事情就一直拖了下来，不过现在事情出现了变数，众大佬就不得不赶快取得一致，否则一旦出现意外，这黑锅总要人来背吧。而这黑锅当然就得内阁来背，所以内阁众大佬们必须尽快取得妥协，否则船翻了，谁也不好过。
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虽然外在的因素迫使内阁要尽快的作出决定，但是东林与反对派很难取得一致，都想让自己的人出缺。这些人都想让自己的门生故吏出任这一重要职位，但是这这位毕竟只有这么一个，安排不了这么夺得人，所以韩犷只能出来打圆场。
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经过激烈的争论，最后中于挑选出来一位，那就是李若生，李若生字紫垣，息县人。万历三十二年(1604年)进士，历枣强、真定知县，因政绩被提拔为御史。天启初年，任大理寺右少卿、寻以佥都御史巡抚甘肃，因反对魏忠贤，遭杖刑，戎廉州。
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之后崇祯皇帝即位，被召回，任工部右侍郎兼右佥都御史总理河道，这人有政绩，有能力，又是工部出身，熟悉河道事务，最为重要的是这位在天启年间可是反对过魏忠贤，又被贬谪过的。
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在东林看来，李若生这个人，当初咱们可是在一个战壕里的战友，又一起蒙过难，所以这人还是值得提拔的。而在反对派看来，李若生这个人政治上还是属于比较中立的，即使提拔起来也不会对自己造成多大的伤害，于是也没有激烈的反对。
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内阁既然已经达成一致，于是韩犷立即上疏崇祯皇帝，要求朝廷立即派遣官员前去接手吕宋的政务，已达到稳定吕宋局势的目的。崇祯皇帝也觉得还是尽快的派遣官员到吕宋去比较好，因为朝廷即使用武力得到了吕宋，也面临这西班牙的疯狂报复。
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杨一鹏接到圣旨之后，也没有怠慢，想要赶紧启程去吕宋。但是杨一鹏也明白，自己一个光杆司令去了吕宋也是没有任何的效果的，所以杨一鹏等自己的属官都到齐之后，才扬帆前往吕宋任职。
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等杨一鹏极其一干属官到达吕宋之后，已经是夏末了，在到达吕宋之后，杨一鹏极其部属立即投入到恢复重建吕宋的工作之中。杨一鹏首先会见了当地的华人领袖，并对他们给予了高度的赞扬，而且又向朝廷推荐了几十位当地有名望、有能力的华人领袖为官。
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接着杨一鹏又接收了教会以及西班牙殖民者占据的良田，并准备安排从内地来的移民实边的群众前来耕种。杨一鹏还加强了马尼拉周围的防务，加固了城防和炮台，还召集了工匠，使得西班牙在马尼拉建造的武器工厂恢复了运转。