严却保持了沉默，因为他的兄弟毕自肃是袁崇焕的老部下，所以毕自严对袁崇焕在广宁整训兵马一事不闻不问，只是尽力提供前线所需粮草和兵饷。
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内阁接到部分朝臣要求袁崇焕尽快出兵的奏章之后，也对袁崇焕整训一事展开了激烈的讨论。钱龙锡等人认为，京城离黑山前线太远了，所以前线的一些事情朝廷并不了解，所以还是尊重前线将领的判断的好
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而钱谦益等人认为，朝廷财政紧张，西北大旱，而且民变不断，再加上北方察哈尔蒙古不稳，所以还是赶紧与后金决战，然后京军回防京城，以应变蒙古可能的犯边行为，再说，在怎么耗下去，朝廷的财政可能要支持不下去了。
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而温体仁和周延儒两个人，对朝廷的争论，却保持了沉默，其他的一些大臣问他俩对此事的看法，这二位愣是不表态。
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其实温体仁和周延儒以及他们所代表的既得利益集团一直在揣摩崇祯皇帝的态度，而一些既得利益集团的大臣对一些朝臣要求朝廷下旨催促袁崇焕尽早与后金决战的看法嗤之以鼻。
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其实部分既得利益集团的大臣们都是很有才华的人，他们明白，现在能收拾辽东残局的只有袁崇焕一个人，如果这次朝廷催促袁崇焕尽快与后金决战，而袁崇焕遵从朝廷的旨意，与后金决战而大败的话，辽东怎么办，还有谁能像袁崇焕一样上辽东稳住局面。
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所以部分既得利益集团的大臣力挺袁崇焕，而兵部尚书孙承宗也公开表态支持袁崇焕。而温体仁和周延儒在经过一段不断的时间观察后，他俩感觉崇祯皇帝的态度好像是偏向袁崇焕的，所以这两位终于公开表态了。
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而袁崇焕和孙承宗一样，是中立派，但有些偏向东林，所以刚开始争论的时候，朝廷大臣们尚可平心静气的展开讨论，不过当温体仁和周延儒发表意见之后，朝廷中的争论就带有不少的火药味了。
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温体仁和周延儒公开支持袁崇焕，这就让钱谦益等东林骨干有些恼火了。在钱谦益等人看来，温体仁和周延儒等人这纯粹是对东林的挑战，于是钱谦益等人纷纷掉转枪口，对温体仁和周延儒展开猛烈的抨击。
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钱谦益等人纷纷弹劾温体仁和周延儒，说温体仁和周延儒身为阁部大臣，责任重大，却在其位不谋其政。不过钱谦益等人还是很明智的，没有将火撒到袁崇焕的头上，一方面因为袁崇焕只能说也是和东林交好，就怎么撕破脸皮也不好。
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在一方面，袁崇焕的坐师是孙承宗，而崇祯皇帝对孙承宗、袁崇焕那可不是一般的信任，所以就因为这小事与孙承宗、袁崇焕等人公开决裂，那可是不明智的事情，所以钱谦益等人弹劾温体仁和周延儒的奏章中，还是有所保留的。
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袁崇焕也听闻了朝廷对他光整训军队，不思出兵救援黑山的争论，所以袁崇焕也写奏章向朝廷说明情况。袁崇焕说后金集结主力兴兵攻打黑山，而自己所部官兵新兵颇多，而增援的京军对辽东的情况又不熟悉，面对凶悍的后金骑兵，明军非经相当时间的整训才可以和后金进行决战。
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朝廷在接到袁崇焕的辩白奏章后，再加上和稀泥的崇祯皇帝的明确表态，崇祯皇帝说：将在外，君命有所不受。这分明是力挺袁崇焕，再加上户部尚书毕自严都没抱怨什么，所以朝廷之间的争论渐渐的平息下来了。