当时阉党给熊廷弼定的罪是：失陷广宁、贪赃纳贿。所以东林官员们在这两个罪名上做文章，说失陷广宁是王化贞的责任，至于贪赃纳贿则是阉党的诬陷之词，不足为信。至于说熊廷弼擅自放弃河西大片土地，是因为后金军力强大，熊廷弼没有足够的兵马与之相抗衡。
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温体仁、周延儒和闽洪学、钱向坤对东林的说法嗤之以鼻。周延儒说，丢失广宁以后，辽东还有三万余官兵，锦州、大、小凌河、宁远、前屯等诸多城堡还在朝廷之手，而熊廷弼大人竟然不组织抵抗，却擅自放弃河西大片领土，罪莫大焉啊。
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东林也知道，熊廷弼擅自放弃河西，退守山海关确实是失误了，而熊廷弼也应该负责，可是这个熊廷弼毕竟和东林有密切的关系，再说，东林也想凭借这这个事打击既得利益集团，所以东林硬着头皮在那里为熊廷弼辩护。
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温体仁怪声怪气的说道：想当初袁崇焕大人率领不到两万的孤军，在宁远城与建酋激烈的交战，毙伤建酋首领努尔哈赤。而熊廷弼大人驰骋辽东多年，却不敢率领数万辽军在锦州、大、小凌河、宁远、前屯等诸多城堡与建酋决一死战，何其怪哉？
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温体仁这番话把东林呛得够呛啊，事实如此啊，想当初熊廷弼要是在锦州、大、小凌河、宁远、前屯等城堡与后金血战，纵然是战死，也不会祸及家人；可是熊廷弼他没有率军死战，而是让军民一体撤到山海关以西，熊廷弼这么做，确实不妥。
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东林想反驳温体仁，他们还真不好反驳，于是东林就说，熊廷弼是对丢失广宁有责任，但是王化贞就没有责任吗？丢失广宁的主要责任应该由王化贞负，要不是王化贞布置失当，不听熊廷弼的，广宁也不至于丢失。
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所以丢失广宁的责任光由熊廷弼背行吗，合理吗？再说，熊廷弼三次到辽东任职，对朝廷有多大的贡献。即使追究丢失广宁的责任，判熊廷弼的罪，不是还有八议吗，在怎么说也不至于判熊廷弼死罪吧。
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所谓八议就是，议亲、议故、议贤、议能、议功、议贵、议勤、议宾。熊廷弼在前两次辽东任职期间，在辽东整修武备，制定官制，有效的抵御了后金的侵袭，这是功，是贤，是能啊。所以你们怎么能判熊廷弼死刑，而放过王化贞啊？
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东林抓住这点，猛烈的抨击既得利益集团，并且要求重审熊廷弼一案，对有关玩忽职守的官员进行调查，惩处。既得利益集团看到东林露出了獠牙，他们那能坐得住啊。
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重审熊廷弼一案没有什么，不过要处理审理熊廷弼一案时的有关官员，那就不行了，那是正式阉党和东林斗争的关键时期，是官员们站队的时期，站错了对不仅身家性命难保，还要祸及子孙。
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所以当时的的官员们，有的沉默不语，有的为熊廷弼喊冤，有的助纣为虐，还有的辞职回乡。而助纣为虐的官员们不少都是高级官员，有的现在还朝廷任职。所要追究责任的话，首先就是那帮助纣为虐的人跑不了。
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既得利益集团都是从天启朝过来，有的在熊廷弼一案时，就曾经助纣为虐，他们心里那个气啊，都心说你们东林这要是干什么啊，许多的重要职位都是你们的人，或者是倾向于你们的人在任职，你们还想要什么，难道要把我们赶尽杀绝吗？
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东林正事抱着这个心态，要把朝中那些非东林的，全部赶出朝廷，因为就我们东林是一心为朝廷的，其他的都是邪党，都不配站在这朝堂之上。
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东林的这种态度引起了很多大臣，包括那些和东林交集不多，但还是能一心为公的中立派大臣的反感。他们都觉得东林太霸道了，做事有些过了。所以说，东林的那些政敌，都是自己树立起来的，跟别人都没有关系，纯粹是东林自己没事找事。