都御史贾继春等人以及充任过《三朝要典》副总裁施凤来，杨景辰等人自然不能坐视不理，于是双方争论的愈发激烈
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崇祯皇帝此刻也是十分的头大，明朝的灭亡一个主要的原因就是党争，内斗。这些大臣的心思都在争权夺力，打压异己上。现在崇祯皇帝面对着这复杂的局面，还真有些棘手。面对后金咄咄逼人的攻势，以及即将到来的农民起义，现在必须稳定政局，大臣们不能在内斗，虚耗大明皇朝的实力了。
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想到此处，崇祯皇帝觉得现在是乾纲独断的时候了。崇祯皇帝即刻下旨“《三朝要典》即行焚毁！”
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皇帝已经下旨，崇祯元年的这场**算是暂时结束了。朝堂上有恢复了平静，不过这不意味着双方就此罢休，他们都在养精蓄锐，准备在一个恰当的时候将对方连根拔起，赶尽杀绝。
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没过多久，御史罗员宾上疏弹劾首辅施凤来，说魏忠贤当政时，施凤来身为阁臣，却毫无主见，致使国家大事，总归魏阉权衡，于上公则上公，欲封爵则封爵，欲建祠则建祠。情面多而担当少，爵禄重而谋国轻，遂使东阁为置邮之所，辅臣为执薄之官。误国徇私，莫此为甚！与施凤来一起被攻击的还有张瑞图。这些天施凤来和张瑞图天天惶惶不安，连连上疏请求辞职。
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崇祯皇帝见他们二人诚心诚意的请求辞职，也就顺水推舟的批准了他们的请求，并且将二人晋太傅衔，让其二人体面的回乡养老。
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接下来请求辞职的是李国晋。这个李国晋在前朝的内阁阁臣中是唯一被众人所尊重的，这不仅在于李国晋在魏忠贤权势滔天的时候，力所能及的保护张皇后及国丈张国纪，还保护了相当一部分的朝臣，而且他为人也很宽厚，崇祯皇帝也很赞赏这个内阁大员。
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不过李国晋心理明白，自从皇帝即位以后，朝廷的局势已经变了，他觉得到时候该退休了，便以家中老母亲已经八十有二，需要有人照顾，请求归家侍奉老母亲。
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虽然说皇帝对李国晋的去职感到惋惜，不过还是批准了他的辞职请求。随着李国晋的离开，崇祯皇帝正式命令韩犷接任内阁首辅，全面主持朝政，并且挑选能臣补充内阁。至此天启朝的内阁正式解散，以东林为主体的崇祯新内阁正式的建立。