在中华军在勿里洞集结兵力的时候，亚齐军在距马六甲东南16里处之蓬果尔登陆，向马六甲城堡推进。葡萄牙马六甲殖民省司令官德.方西沙只能率葡萄牙士兵二百出外抵抗。仅仅200名葡军，硬是将亚齐军队5000人挡在马六甲城堡外围海滩一线整整20日。
亚齐苏丹伊斯坎达尔.穆达放下了自称“无敌勇士”的架子，派人去向荷兰人、法国人求助，希望他们派陆军登陆助战。荷兰人和法国人却只愿意留在马六甲海峡的军舰上，放炮给亚齐苏丹助威。
德.方西沙司令官积劳成疾，因病而由马六甲城防司令德.玛亚继任指挥。这位年轻的指挥官是在果阿官位拍卖会上花钱得到这个职位的（葡萄牙人的卖官鬻爵是公开拍卖的），是个不学无术的贵族花花公子，他一开始带兵打仗，就被亚齐军击败。于是亚齐军三千人进占三宝山，亚齐苏丹伊斯坎达尔.穆达即在以郑和为名的山上的教堂建立总部。另一葡将韦沃斯率军士350人驻守于马六甲城堡外的恰里据点，也被亚齐军所击破，亚齐军遂占领圣约翰山，毁山上的大教堂，并居高临下地威胁着市区，借用荷兰人的大炮轰击马六甲城堡。马六甲已十分危殆。
就在此时，中华军马六甲特遣舰队突然出现，总计有三艘飞字号战列舰、一艘远字号战列舰、30多艘纵帆巡洋舰及福船炮舰、上百艘快舰与辅助舰船。浩浩荡荡的舰队从马六甲海峡东口冲入，与荷兰人、法国人、亚齐人的舰队展开了海战。
荷兰、法国联合舰队总计不过十余艘战舰，能和战列舰级别相抗衡的战舰只有荷兰人的赫克托号。在海战中，中华军得理不让人，以数量质量的优势，将敌军舰船统统击沉。那些亚齐人的舢板和马来型小帆船，根本就没有机会战斗，被中华军战舰用炮火击毁了一部分，其余的一半都逃跑了，亚齐水军提督中华军战舰俘获。荷兰人、法国人联合舰队全军覆灭后，只有少数人逃回了苏门答腊岛，侥幸活下来的人都被中国人俘虏。
马六甲海峡的控制权一天之内就落入中国人手中，这一下，在马六甲城堡附近的亚齐苏丹登陆部队成了一支孤军。
亚齐苏丹伊斯坎达尔.穆达梦想着恢复昔日马六甲王国兴盛时期的疆界。他的梦想和马达兰苏丹阿贡的梦想一样，生不逢时，正好遇到了尹峰和中华公司的崛起。如果没有尹峰，他们在原本的历史轨道上，还能各领风骚几十年的。尹峰没有给他们机会，中国人的大军蜂拥而至，一下子将“山中无老虎、猴子称大王”的亚齐苏丹打回原形。赵铁带着第一师两个团精锐步兵登陆马六甲，第一仗就轻松夺回了圣约翰山。
赵铁觉得打亚齐人很不过瘾，分兵四出：一团主力穿过马六甲城堡北上，一举将集结在马六甲北面的马来半岛各土邦联军击溃，柔佛、彭亨、丁家奴、吉兰丹、雪兰获、霹雳等苏丹小邦联军损失惨重。彭亨苏丹当场反戈一击，站到了中国人、葡萄牙人这一边，翻脸和昨日的盟友打成一团。
另一路中**队以一个营的兵力夜袭三宝山，险些俘虏了亚齐苏丹。亚齐军大败，只剩下数百人保护着苏丹伊斯坎达尔逃往柔佛。没成想阵前倒戈的彭亨军队在半路拦截了他们，将亚齐苏丹俘虏后，作为投名状送给了中华军。中华军也在追击中击败了吉兰丹苏丹的军队，俘获了吉兰丹苏丹。赵铁还毫不客气将柔佛的新任亚齐总督俘虏，随便宣布原柔佛苏丹国已经成为中华公司直接管辖地区。作为对彭亨的奖赏，赵铁将吉兰丹的一部分划归彭亨苏丹国。
从果阿赶来的葡萄牙武装船队由博特.罗指挥，五艘武装商船在马六甲和中华军百余艘战舰汇合。然后，中华军舰队横扫了整个马来半岛的沿海，一直杀到北大年海岸线上。然后，中葡联合舰队南下苏门达腊，将荷兰人、法国人在亚齐的据点一一拔掉。中华公司乘机恢复了在亚齐、旧港的据点，重新开设中华商馆，而把苏门答腊范围内的荷兰商馆统统赶走了。
在尹峰带这大部队攻占马达兰首都克尔塔的同时，中华军第一师进占马六甲，毫不客气地接防了要塞的所有重要地点。
由于马六甲总督如今正好缺位，赵铁就很不耐烦地把一份文件递交给重病中的葡萄牙司令官德.方西沙：这份文件主要部分是葡萄牙向中华公司转让马六甲殖民地的手续，理由是这十年来中华公司为葡萄牙人在亚洲贸易中作出的让步，以及此次战争的费用。同时，附上了特别条款：允许葡萄牙商人在马六甲交易免税十年。
葡萄牙人有苦无处诉，前门驱狼后门进虎，自己只剩下几百号疲兵，五艘武装商船；而面对的中华军却有百余战舰千余门大炮，三千武装到牙齿的步兵战士已经雀占鸠巢。葡萄牙司令官德.方西沙代表马六甲总督，无可奈何地签署了转让协议。这些年，尹峰的葡萄牙文水准没什么长进，这份文件是李丽华起草的。她以女人的细心，把每项条款都写得明明白白，丝毫没给葡萄牙人留一点情面。所有马六甲城堡附属的军事堡垒据点、兵工厂、火药库、物资仓库、教堂等等统统都被中华军接收了，连一根钉子都没放过。
在城防交接仪