舰队重视对于战舰船体的攻击，目的在于摧毁敌舰的航行能力，并最终使其船体破损沉没。而荷兰海军则重视对于敌舰帆桅的攻击，目的在于杀伤对方舱面人员和降低其机动能力，然后最终击沉或者跳帮夺取对方战舰。
中国人的阵列线散开后，大量小型船只发挥了作用，从荷兰舰队的两翼开始了迂回包抄行动，战斗的天平在向中国人方向倾斜。
每艘中华公司舰队都在船头装备号称“粉碎机”的重型大炮，是专门设计来破坏船板的，威力巨大。最大的飞虎号有三层甲板，密布着炮窗；还有甲板上的几十具佛郎机，用来抗击敌人的近距离跳帮进攻。
而荷兰人的战列舰，按照大小分为一层，两层，三层，甚至四层战舰，每层两舷是走廊样的火炮甲板，安放排成长列的大炮，中间则是交通通道。战舰两侧是十至几十英寸的木质船板，双方接舷作战时很难打穿，即便打穿，实心的炮弹也只能洞穿一个窟窿，杀伤力有限。
战舰装甲最脆弱的部分则是舰首舰尾，因为排成战列的时候，舰首舰尾面对的都是友舰，无需特别的保护。遗憾的是天算不如人算，荷兰战舰的设计师没想到尹峰会搞出这种艉射战术：主动打乱自己一方的阵列线，突破进对方的阵型内进行攻击。
中国战舰绕到敌舰尾后，用船头穿甲弹猛轰对方脆弱的艉楼，然后对准炸开的窟窿，向敌舰内发射喷射式的霰弹。由于当时欧洲风帆战舰内部从头到尾没有隔板，这样发射的霰弹可以从舰尾一直打到舰首，在整层甲板上造成屠杀般的杀伤效果。
这样一来，荷兰军的人员损失直线上升，炮手死伤异常惨重。曾经逃脱了中华公司舰队追击的赫克托耳号战列舰被两艘飞字号首尾围攻，互射两个回合之后，赫克托耳号舱内人员伤亡达到了600人的惊人的数字，八成的炮手非死即伤，已经基本失去战斗能力了。
激战中，叶华的旗舰飞虎号一直在寻找荷兰舰队的旗舰。
三艘荷兰战列舰已经有一艘被打残了，其余中型战舰已经有三艘被击沉。但是荷兰舰队还在顽强抵抗，而且还能互相支援，这说明他们的指挥系统还完备无缺。
现在，唯一的问题就是找不到荷兰人的旗舰。这让荷兰军在损失惨重的情况下，依然不崩溃，有组织的抵抗持续了相当长的时间，荷兰的舰长、将军们也可称是克尽职守，荷兰舰队后卫编队的指挥官阿尔发将军在战斗中身负重伤。
最后，还是叶华的旗舰飞虎号主桅望斗的瞭望员用望远镜发现了海军上将乔里斯.斯皮尔伯根的将军旗在阿格硫斯号上。
叶华立刻命令发出火箭信号，集中了三艘主力战舰围攻阿格硫斯号。同时，中国人众多的小型船只象蚂蚁一样蜂拥而上，用大炮围攻周围的荷兰战船，把他们和阿格硫斯号隔绝开来。
井里汶外海海战进入尾声，荷兰海军上将乔里斯.斯皮尔伯根的旗舰阿格硫斯号以一敌三，恶战一个时辰，全船有超过五百人伤亡，成堆躺在船舱内的大多数炮手尸体没有头，殷红的鲜血流淌成河，从船舷的各个破口中流入大海。在可怕的“艉射”战术造成的后果面前，斯皮尔伯根上将已经完全丧失了战斗精神。
傍晚的夕阳下，最后一艘坚持抵抗的荷兰战舰降下了荷兰的奥伦治家族旗帜，挂上了白旗。荷兰人的三艘战列舰被击沉两艘，海军上将乔里斯.斯皮尔伯根的旗舰阿格硫斯号投降被俘。除了三艘快船向巴达维亚逃跑了，其余荷兰战舰非沉既降。
叶华的飞字号战舰只有飞豹号受创严重，另外福船型炮舰、小型快船被击沉八艘，总计死伤六百余人。
中国舰队基本上算是完胜了此次海战，完成了在年底前消灭荷兰舰队的任务。
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