尹峰整整一年泡在了军队中，和新招收的人战士们同吃同住，忙着整编中华军。现在的中华军已经开始形成自己的完整参谋体系、军官团、军事教育体系、后勤供应体系等。赵铁的第一团、麦德的第二团、李星的第三团、赵宣明的第四团、颜思齐的第五团作为中华军步兵野战主力开始在吕**原轮流进行多兵种联合演习，最多一次集中了四个团的主力，初步开始试探把部队作战编制向师一级发展。
同时，李魁奇炮兵团、安得烈的骑兵团，鲁大海的后勤部队都开始加入到了多兵种联合军事演习的过程中。尹峰自己也是没有察觉，他的努力已经使自己的军队在技术、战术水平快速超越了欧洲列强和周围所有国家的武装力量。
水军舰队的操练也开始从支援陆军的角色向独立作战方向发展。鹿儿岛平原之战时，水手火枪队和中华军步兵的配合出现了重大纰漏，差一点使得战场形势转变。事后，尹峰在军校召开了解几次检讨会，大家一致认为，这是由于水手火枪队平日的训练和作战要求和步兵完全不一样所导致，而且水手们和步兵兄弟平时缺乏互相之间配合作战的练习，也是重要原因。
因此，尹峰参考后世海军陆战队和欧洲列强殖民地驻防分队的经验，把水手火枪队完全当作了海上机动兵力来使用：南洋地方中华公司属地经常发生的土著**，以后就由海上机动能力强的水手火枪队来负责平定，让水手们在小规模激烈战斗中发挥机动性和灵活性；各地剿灭海盗的活将全由水手火枪队来完成，中华军的步兵职能将向专门进行大规模陆战阵战发展。各殖民地驻防队的任务也将全部转由水手火枪队来担任。当然，水手火枪队和舰队也要参加大规模战役，担任战略战术任务，不过，在尹峰想来，短时间内，中华军还不会发起大规模的战略性的进攻战争。
水军舰队的海战训练则已经被尹峰逼着大跃进到了另一时空的纳尔逊时代。 这一方面是尹峰作为穿越者的先知先觉所发挥的作用，同时也是这些年中华军大炮巨舰主义表现出巨大影响力之后，水军一些将领主动思考研究后的结果。
尹峰在万历四十年（1612年）正式在水军内部发布了《作战条例》，这条例体现了尹峰对海战战术的超前理解的结果。中华军从此以后特别重视对于敌人战舰船体的攻击，目的在于摧毁敌舰的航行能力，并最终使其船体破损沉没。而当时各国海军依旧在海战中重视对于敌舰帆桅的攻击，目的在于杀伤对方舱面人员和降低其机动能力，最终通过跳帮夺取对方战舰。
尹峰特别盗版了纳尔逊的“艉射”战术。
中华军海上战舰最大装备的加农炮已经达到四十磅，专门设计来破坏船板的，威力巨大。
当时欧洲海上列强的战舰，按照大小分为一层，两层，三层，甚至四层战舰，每层两舷是走廊样的火炮甲板，安放排成长列的大炮，中间则是交通通道。战舰两侧是十至几十英寸的木质船板，双方接舷作战时很难打穿，即便打穿，实心的炮弹也只能洞穿一个窟窿，杀伤力有限。
战舰装甲最脆弱的部分则是舰首舰尾，因为排成战列的时候，舰首舰尾面对的都是友舰，无需特别的保护。遗憾的是天算不如人算，当时各国战舰的设计师没想到会有人使用“艉射”打法。所谓“艉射”，就是突破敌方战舰阵列，在混战中绕到敌舰尾后，用穿甲弹猛轰对方脆弱的艉楼，然后对准炸开的窟窿，向敌舰内发射满天飞花般的霰弹。由于当时军舰内部从头到尾没有隔板，这样发射的霰弹可以从舰尾一直打到舰首，在整个甲板上造成屠杀般的杀伤效果。
这也是尹峰设计用来对付西班牙舰队的人战术。西班牙帝国收复吕宋的人远征军已经出发，这个 消息是叶华船队带回来的。
中华公司的第一艘主力战舰飞龙号和新兴号，带着两艘三桅福船，五艘二桅福船，满载着丝绸、陶瓷、刺绣、茶叶、布匹、铁器、书籍等货物，五年前离开台湾港驶往欧洲。经过近两年的航行，叶华船队绕过了好望角，北上大西洋东岸一带，经过西部非洲沿海，一直到达葡萄牙首都里斯本。
叶华船队是第一支正式来到欧洲的中国贸易船队，到达里斯本的这一天，里斯本全城的教堂一齐鸣钟，为中国人带来的财富和文化而表示庆贺。财富当然是满船的货物了，这些直接来自中国的货物遭到了大批欧洲商人的抢购，使得叶华船队大大赚了一笔，各国的货币和金银堆满了中国船的甲板。
文化交流的不二人选自然是尹峰的舅子曾山的事了；整个船队千把号人，只有曾山是参加了科举考试的秀才老爷，贝尔纳多等犹太商人以及尤文辉等修道士在介绍他时，都把“博士”的帽子扣在他头上。
本来因为仕途无望、看多了官场黑暗灰心丧气的曾山，几乎已经放弃了在文学方面的努力，不料如今在欧洲出人意料地被当做了中国文化的代表。不仅里斯本的达官贵人连番邀请他去赴宴座谈，不久就有里斯本主教出面邀请他和中国商人代表一起去罗马梵蒂冈觐见教皇。
叶华指挥飞龙号和新兴号，满载着在里斯本没有