倭寇们的小艇是由葡萄牙人的多桨快艇仿制而来的，当时明朝人也有仿制，称为蜈蚣船。眼下倭寇的三只小艇正在慢慢接近搁浅的果阿号。镇定下来的尹峰吸了口气，回转身看着乱作一团的船员，大声用葡萄牙语喊：“你们想活着吗？”
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由于风向问题，倭寇的小艇必须划到接近海岸线的地方，然后顺风顺海流方向驶近果阿号船头。这给了尹峰一点准备迎战的时间。
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尹峰满头大汗、口干舌燥，他费尽口舌耗尽力气才指挥众人搞出这么个临时掩体。受伤的船长罗德里格斯在最后昏迷前下令全体船员听从尹峰命令，那些黑人因而比较听从指挥，印度人和马来人船员则一直处在惊慌失措的状态下。曾景山带领曾家的家丁仆人无条件听从尹峰的命令，虽然他根本不理解尹峰为何要放弃船头的守御，全部人员都集中在船中央。
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贝尔纳多在刚才枪战开始时就躲到船底舱去了，他的两个仆人—也是黑人倒是一直在甲板上。马家罗紧跟着尹峰，左手握一把榔头，右把斧头。尹峰也蹲下身，仔细检查了一下，回头对马家罗说：“战斗开始后，一定要等我命令才能冲出去！”他又用汉语对曾家的人说了一遍。
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眼下他有15名黑人掌握了15只火绳枪，5名马来船员操作5把扳机弩，还有几名在发抖的印度人和5名曾家家丁，拥有刀剑斧头棍棒等兵器。同时，架在木箱上的一门小铜炮也准备好了，由尹峰掌握。船头的小铜炮因为船长二副都已受伤昏迷，无人知晓如何拆卸，只好放在那里由它去了。
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伏在船舷瞭望的曾景山大喊道：“他们来了。”
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话音未落，一阵零落的火枪声，枪子把船头架设小铜炮的地方打得火星直冒。倭寇吸取了第一次进攻的教训，由于小铜炮射程近，他们留下一只小艇停在小炮射程外，不停用火绳枪射击船头，消灭一切可能出现的火力点;另外两只小艇上的倭寇在火绳枪掩护下，快速划向果阿号船头位置。
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船头到中部临时掩体的位置也就二十几步的距离，倭寇一旦登船，只有一次火枪发射的机会。尹峰第一次指挥这种冷热兵器混合时代的作战，心里拼命回忆记忆中的战争史资料，无数战争电影的情节也涌进脑海。他连续做了几次深呼吸，把所有影像排出脑子，静下心死死看着船头方向，大声喊道：“听我命令，注意……”
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连串的抓钩绳索甩上了船头，倭寇们矮小的身影动作敏捷地出现在船头。他们一下跃过船舷，站定身子，双手紧握倭刀，每个人都双眼通红充满杀气。但是眼前甲板上没有敌人，连前次进攻打死的船员尸体也没有。
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第一批上来日本浪人大约10人，领头的一个黑衣武士发现了上层甲板中部古怪杂乱的堆积物，后面还有烟雾在升起（其实就是火绳枪上的点火绳燃烧的烟），疑惑地向这里走去。
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他才走出一步，一直在木箱缝隙中观察情况的尹峰突然站直身子，大喊一声：“Fogo！”（葡萄牙语：开火）
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黑人火枪手纷纷站直身子，“噼噼啪啪”一阵枪响，硝烟腾起弥漫了整个船体中部。虽然只是15支火绳枪的齐射，加上尹峰的手枪射击，但这硝烟也使尹峰猛地咳嗽了一下。烟雾在几秒钟后就被海风吹散，10名倭寇只有一人还站在哪里发呆，其余的都已躺在甲板上，或死或伤。尹峰还没来得及说什么，扑扑扑，马来人的扳机弩发射的短箭已射出，有两支箭插在了那个发呆的倭寇胸口。
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尹峰大怒，回头看去，那几个马来船员手拿着弩还在发愣。这弩箭原先安排是第二轮射击才动用的，以弥补火绳枪装填速度太慢可能引起的问题，现在可好……他张张嘴，想骂什么最后还是没骂出来，只是大声说：“快装弹药！”
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那些黑人也被自己的射击效果惊呆了，这时才想起要装弹药，七手八脚地忙碌起来。尹峰发现马来人还在发愣，没好气地冲他们大喊：“快上弦装箭啊！”
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曾景山突然又大喊：“又有人上来了。”
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几个身影迅速出现在船头，白光闪过，几把飞刀射杀了几名正在埋头装子弹的黑人火枪手，没等尹峰下令，惊慌的黑人已经“啪啪”开出了几枪，一个人都没打中。又有几名倭寇上了船头，然后发出一声大吼，一起向果阿号船员的阵地扑来。
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没办法了，火绳枪是来不及发射第二轮了。尹峰用手中火绳点燃了小铜炮。