”商鞅因此大功，受封于商（今陕西商县东南商洛镇）15个邑，号为商君。
公元前338年，秦孝公去世，太子驷即位，即秦惠王。公子虔等人告发商鞅“欲反”，秦惠王下令逮捕商鞅。商鞅逃亡至边关，欲宿客舍，客舍主人不知他是商君，见他未带凭证，告以商君之法，留宿无凭证的客人是要治罪的。商鞅想到魏国去，但魏国因他生擒公子昂，拒绝他入境。他回到自己的封邑，举兵抵抗，结果失败战亡，而后被下令车裂其尸。
公元前350年，商鞅又实行了第二次改革，改革的主要内容是：
一、废井田，开阡陌（阡陌就是田间的大路）。秦国把这些宽阔的阡陌铲平，也种上庄稼，还把以前作为划分疆界用的土堆、荒地、树林、沟地等，也开垦起来。谁开垦荒地，就归谁所有。土地可以买卖。
二、建立县的组织，把市镇和乡村合并起来，组织成县，由国家派官吏直接管理。这样，中央政权的权力更集中了。
三、迁都咸阳。为了便于向东发展，把国都从原来的栎阳迁移到渭河北面的咸阳（今陕西咸阳市东北）。
这样大规模的改革，当然要引起激烈的斗争。许多贵族、大臣都反对新法。有一次，秦国的太子犯了法。商鞅对秦孝公说：“国家的法令必须上下一律遵守。要是上头的人不能遵守，下面的人就不信任朝廷了。太子犯法，他的师傅应当受罚。”
结果，商鞅把太子的两个师傅公子虔和公孙贾都办了罪，一个割掉了鼻子，一个在脸上刺上字。这一来，一些贵族、大臣都不敢触犯新法了。
这样过了十年，秦国果然越来越富强，周天子打发使者送祭肉来给秦孝公，封他为“方伯”（一方诸侯的首领），中原的诸侯国也纷纷向秦国道贺。魏国不得不割让河西土地，把国都迁到大梁（今河南开封）。
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商鞅变法试民
商鞅是卫国人，姓卫氏，名鞅，汉族人。他见卫国势弱，就到魏国，求事于魏相国公叔痤，公叔痤见他是个贤才，推举他为中庶子，一有大事，痤总要与商鞅一起谋划，并总是成功，痤很器重他，欲引荐他做更大的官。只可惜痤不久得了重病，但痤还是告诉魏惠王“卫鞅虽然年轻，但他是当世奇才，他若做了相国，比我强十倍。你如果不用他，就把他杀了，以免后患。”。公叔痤又对商鞅说“我先公后私，如果魏王不用你，你赶快逃走，我已建议杀你”，商鞅想：既然魏王不听痤的话用我，那他也不会听他的话杀我的。他于是不走。果然，惠王认为商鞅没什么作为，这是公叔痤病重，在说糊涂话，因而，没有用他，也没有杀他。
商鞅听说秦孝公四下招贤，于是来到秦国，求见秦孝公。孝公见商鞅高谈阔论、泛泛而语、不着边际，听了一会儿就睡觉了，一连三次如此。商鞅没有气馁，最后以“伯术”为题展开话题，却正中孝公下怀，两人交谈三日三夜，孝公不觉过瘾。孝公大喜，封他为左庶长。于是，商鞅果断颁布变法之道。他想测试一下民众对变法的态度，更为了取信于民，以便新法能顺利地贯彻、实施下去。
商鞅派人把一根三丈长的木头放在闹市中，下令说：“谁能把木头搬到北门去，就奖赏十金”，老百姓纷纷来看，但都抱怀疑的态度，无人去搬；商鞅把赏金加到五十金，大家更加猜疑：秦国可是从来没有出这么重的奖赏的。有一人不信邪，心想：虽然没有这么多的奖金，但总有一些吧。他扛起木头，搬到北门，跟随的观众很多。商鞅如数地兑现了奖金，大家这才相信：商鞅出令必行！
第二天，商鞅颁布新法，并使新法顺利地实施了下去。秦国大治，其政治、经济等各方面都得到飞速发展。但是，由于新法侵害了王亲贵族等统治阶层的切身利益，同时，商鞅在执行变法中过于严酷，当孝公去世、惠文公即位时，商鞅最后落得个“五马分尸”的悲惨结局，实为可歌可泣、可悲可叹。
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商鞅变法成功的原因
一、商鞅变法顺应了历史发展的潮流。春秋战国时期是奴隶制崩溃、封建制确立的大变革时期，商鞅变法顺应了时代的要求和历史发展的潮流，是为变法成功的根本原因。
二、商鞅变法得到了统治者的支持。
三、商鞅确立了“治世不一道，便国不法古”正确的变法指导思想，改革态度坚决，取信于民。
四、商鞅不顾个人安危,敢于同旧势力坚决斗争。
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商鞅两次变法的主要内容
公元前356年第一次变法，主要有下列几点：
1．颁布法律，制定什伍连坐制度，轻罪用重刑。将李悝《法经》颁布实行，增加了连坐法。就是五家为伍，十家为什，互相告发，同罪连坐，告发“奸人”的与斩敌同赏，不告发的腰斩。一家藏“奸”，什、伍同罪连坐。客舍收留无官府凭证的旅客住宿，主人与“奸人”同罪。
2．奖励军功，建立二十等军功爵制，秦二十级军功爵位制度[从低到高]：