年3月～1979年5月，因从事反对军政府的活动，她先后六次被捕入狱和遭软禁。1982年11月，出任人民党代主席。1985年1月至1986年4月，再次流亡英国。1986年4月回国领导人民党组织反对齐亚·哈克总统的运动。1988年11月领导人民党赢得大选，同年12月2日出任总理。她是伊斯兰国家中第一位年轻的女总理。199O年8月6日，被伊沙克·汗总统解除总理职务。1993年1O月19日，再次在大选中获胜，二度出任总理。1996年11月5日，被莱加利总统以“腐败和无能”为由解除总理职务。
1987年，贝·布托在母亲的安排下与扎尔达里成婚。扎尔达里的家族在巴基斯坦的名望不如布托家族高，但却也是卡拉奇市有地位的家族之一。扎尔达里曾在伦敦商学院接受高等教育。他喜欢马球并拥有一个属于自己的马球队。贝·布托出任总理后，扎尔达里也很快出现在政治舞台上，1996年7月，被贝·布托任命为政府投资部长。在此之前，就有一些风言风语。有些媒体公开地把他称作“抽一成先生”，意思是说扎尔达里利用自己的影响，从事各种商业活动或作为中介，收取回扣和佣金。1996年11月，贝·布托的第二任政府被推翻后，扎尔达里受到10多项指控。其中包括腐败、毒品走私、谋杀等，两年多来一直被关押在兰迪监狱。在整个瑞士银行存款案中，扎尔达里也是主要的被指控对象。
神秘的瑞士来客
贝·布托及其家族面临贪污腐败等指控已不是第一次。早在1990年8月6日，时任总统的伊沙克·汗就是以政治上无能、治理不善和贪污腐败、大搞裙带关系为由解散她的政府的。1996年11月，莱加利总统解散了她的第二届政府，贪污腐败也是一条重要理由。1997年3月在大选中获胜的穆斯林联盟（谢里夫派）上台执政不久，就开始成立清查机构对贝·布托及其家族成员在其任期内腐败行为进行审查。在9月份瑞士政府宣布暂时冻结布托家族的银行帐户之前，巴基斯坦政府就已进行了长达数月的调查取证工作。但苦于缺少有说服力的证据，该项调查一直没有大的进展。政府向民众许诺的彻底清查腐败分子的诺言一直难以兑现。民众也开始对政府的整治腐败、建立廉洁政府的能力表示出怀疑。负责调查工作的人员也已多次遭到批评。整个调查工作陷入困境。
就在巴基斯坦政府的调查人员感到一筹莫展的时候，黑暗中忽然出现了一道亮光。7月份的某一天，一位神秘的瑞士人给巴基斯坦政府清查办公室打来电话，声称他掌握着谢里夫政府的主要政治对手——巴基斯坦人民党主席——贝·布托及其家族从事非法活动的秘密材料。这位神秘的告密者拒绝说明自己的身份。他以不容置疑的口吻，要求巴政府调查部门派人到伦敦接头。
两天后，巴基斯坦政府清查办公室即派出了一个由高级官员和情报人员组成的4人小组秘密地登上了飞赴伦敦的国际航班。经过14个小时的连续飞行，该小组人员于第二天中午抵达伦敦希思罗国际机场。离开机场，他们径直驱车直奔位于“金融城”区的希尔顿饭店。在那里，那位神秘的瑞士人已提前一天到达。此刻正在12楼一个豪华的套间里等候巴方调查人员的到来。
后来，据巴基斯坦清查机构透露出来的消息说，调查人员此次伦敦之行收获颇丰。那位神秘的瑞士人交给巴政府的秘密材料中，包括贝·市托的丈夫扎尔达里和母亲努·布托在海外非法注册代理公司和开设银行账户的亲笔签名，此外还有一些有关交易中收取回扣和佣金的记录。从这些材料中，可以看出，布托家族在海外的代理公司每年的营业额约有数千万美元。而其家族成员，主要是扎尔达里和努·布托夫人先后收取的回扣和佣金可能达到数百万美元之多。如果这些材料最终被证明属实的话，也就预示着贝·布托家族的末日就要到了。
迄今为止，据称是出于“保密原因”，巴基斯坦政府一直未正式公布这些材料。它只是通过调查机构官员零零散散地介绍过这些材料的内容，并向记者出示过两份材料的复印件。其中一份材料是一家名为凯普里考恩的贸易公司要求从花旗银行向花旗银行（瑞士）转账的单据，其编号代码为342O34。在受益人一栏中，签名是“阿西夫·阿里·扎尔达里”，地址是贝·布托的家——位于巴基斯坦最大城市卡拉奇的比尔瓦尔宅邸。单据的其他各栏表明，该转账单的执行人为詹恩斯·舒尔格利希，其身份是凯普里考恩贸易公司的代理人。调查机构出示的另外一份材料表明，有6家在英属维尔京群岛注册的公司事实上属布托家族所有。这6家公司是：包麦尔金融公司、达尔吉尔联合公司，迈里斯顿证券公司、马尔顿商务公司、纳萨姆·亚历山大公司，以及上面提到的凯普里考恩贸易公司。据调查人员称，布托家族成立这些海外公司，主要从事巴基斯坦政府与外国公司贸易的中介和代理业务，从中收取佣金和回扣。也有一些主要是借公司名义，专门代布托家族管理在瑞士及其他国家和地区的存款，设立公司实际上只是一个幌子。在这份材料中，据