湖北杨来嘉、洪福的叛变，被清军击退，没有引起更大的骚乱。严重的问题是发生在四川。吴三桂一起兵，圣祖就十分关注四川，他认为，四川与云南接壤，估计到“贼兵必犯巴蜀”，先调驻守西安的西安将军瓦尔喀火速进川，指示他凡自云南入川的险要之地，“俱行坚守”。《平定三逆方略》，卷1，18页。原令副都统科尔崑驻防太原，他还未及起身，又改赴西安，接替瓦尔喀守西安的职务。圣祖仍放心不下，续增都统赫叶及瑚里布、穆占，副都统廷布率京城官兵同往四川。此路军由赫叶、瑚里布统辖，西安兵由瓦尔喀指挥，两路军应尽快会合，“同心协力”，守住四川。《平定三逆方略》，卷2，1~2页。赫叶与新任命赴荆州增援的勒尔锦同一天离京出征。行前，圣祖亲行告祭礼，出西长安门，目送两将军，又派内大臣，礼兵两部大臣在郊外设酒饯行。圣祖这一举动，是表明他把四川看成如同荆州一样重要。《平定三逆方略》，卷2，8页。
正当赫叶等自京动身之时，四川巡抚罗森派人至京，报告全川军心不稳，颇怀异志。圣祖惟恐情况有变，下令催促副将瑚里布等速进兵，选轻骑先行。
还没等援兵赶到四川，已传来四川提督郑蛟麟与川北总兵官谭弘合谋叛变的消息。谭弘是四川万县人，原为明朝总兵官，顺治三年，谭弘与其弟谭诣、谭文都投靠了南明永历，谭弘被封为“新津侯”，他的两个弟弟也晋封公爵。谭氏三兄弟长期割据四川一方，与南明诸将争衡，直到顺治十六年，谭弘、谭诣才降清，封谭弘为“慕义侯”，授予川北总兵官之职。郑蛟麟原明朝都司，还在清入关前，从松山来降清，官至四川提督。三桂反叛时，即于康熙十三年正月派王屏藩进兵四川，策动叛乱。谭、郑合谋响应，接受三桂的官职，封谭为“川北将军”，蛟麟为“总督将军”。《逆臣传·谭洪（弘）传》，卷2，18~19页。