卷下，304页；《庭闻录》，卷3。
如何处置永历，毫无疑问，三桂个人不敢也不能自作主张。处置永历是一件要事，必须由朝廷来决定，他只能执行。奇怪的是，清朝官方史书对此重要问题却没有记载，只有个别史书仅记：“仁皇帝（圣祖）命恩免献俘。”《小腆纪年附考》，卷20，21页。照清朝以往的做法，凡俘获或投诚的明宗室人员，一律解送北京，给予适当安置。目的是防止明朝的这些后裔留在地方为反清势力所利用，煽惑闹事。只有坚持明朝立场，与它为敌的，一经擒获，无不就地正法处决。清兵进关后，收降了不少宗室人员，也处死了一大批。其中，清对明宗室至关重要的人物是不会轻易放过的。清入北京后，有“朱三太子”案，出现了真伪太子，这使朝廷很不安。如果崇祯帝的太子真的还在，对它是一个潜在的危险。因此，它以假冒太子之罪名，把已被认出的太子也给杀了。至今，此事成了难解之谜。清兵下江南，破弘光政权，把立为皇帝的福王杀了。隆武政权的唐王朱聿键兵败被擒，没有解往北京，也是就地汀州（福建长汀）处死。永历政权的皇帝朱由榔维持时间最长，在云贵达十四年之久，颇得人心。现在已被擒获，留此人物，已属无益，可能还给刚刚立足的清政权造成威胁。根据它以往的政策，可知清朝统治集团不会对永历实行特赦的。但此时形势与擒福王、唐王时有所不同。在消灭了这两个政权后，永历已远逃缅甸，大陆形势趋于稳定，而一经把他擒获，危险消除，为了笼络人心，留下永历一条命，也是可能的。尽管官方史书不载清朝对永历及亲属的处置意见，并不能说它没有做出相应的决定。这是绝对不可能的！也许清朝统治集团感到屠杀手无寸铁，又无缚鸡之力的永历母子不是什么光彩之事，因此，在它所修的所有官方史书包括《实录》中，有意回避，漏载此事，只记擒获永历及其亲属，绝笔不提朝廷的处置意见，亦不书永历死事。《清圣祖实录》，卷6、（蒋氏）《东华录》等书，在康熙元年二至四月记事条下，均失载。连私家著述的某些书，似为避讳，亦不载。实际上，决定永历命运的，还是吴三桂起了相当重要的作用。