收水，结果黄帝阵脚大乱，溃败而归。后来，更是九战九败。
没有办法，黄帝率部退到泰山，躲避在昏暗的雾气中。他三天三夜不吃不睡，冥思苦想退敌之策。正在的时候，一个人首鸟形的女子出现在黄帝面前。黄帝用最高礼节稽首再拜，伏在地上不敢起来。这个女子说自己是"九天玄女"，问黄帝有什么要求。黄帝说自己总是打败仗，欲求万战万胜之法。于是，九天玄女向黄帝传授了"玄女战法"。得到九天玄女传授的战法之后，黄帝又请来旱神女魃助战。女魃会收云息雨，住在昆仑山上。为了振奋低落的士气，黄帝派人去东海之外七千里处的流波山，捉来体壮如牛、苍身无角、吼声如雷的一足怪兽"夔"，剥下它的皮做战鼓。同时派人捉来雷兽，用其身上最大的骨头当鼓槌，敲一下夔皮战鼓，声音能传出五百里，足以震慑四方。另外，黄帝又用九首馗牛的皮做了数十面战鼓，与夔皮战鼓一起组成鼓阵。一切准备就绪之后，黄帝率部重出泰山，在涿鹿的旷野上，与蚩尤展开激战。蚩尤派出魑（chī）魅等山林中害人的怪物进攻黄帝，黄帝让手下吹牛角发出龙吟的声音以御之，结果魑魅应声而亡。蚩尤又运用神术，升起漫天大雾，笼罩黄帝的队伍。由于三天三夜分不清方向，士卒们充满恐惑。黄帝命令风后效法北斗天机制作指南车，用来分辨方向，顺利撤出包围圈。
黄帝命应龙再次腾空喷水，应龙张开巨口，江河之水冲向蚩尤的军阵。蚩尤急派风伯、雨师应战，狂风裹着暴雨又向黄帝的军阵袭来。黄帝马上派旱神女魃上阵，女魃施展神力，刹那间烈日当头，热浪滚滚。她走到哪里，哪里就风雨全消。风伯和雨师无计可施，慌忙败走了。蚩尤见状，亲率八十个兄弟冲杀上来。蚩尤兄弟强悍勇猛，几乎无人能敌。黄帝手持雷兽鼓槌，擂击夔皮战鼓。顿时鼓声震天，蚩尤的八十个兄弟被吓得失魂落魄，很快就战死了。蚩尤见状纵身飞向空中，迅速逃离了涿鹿的原野。黄帝命令手下布好鼓阵，一声令下，数十面馗牛皮战鼓同时敲响，连擂九下，地动山摇。已经飞到冀州中部的蚩尤应声落地，再也逃不掉了。捉住蚩尤以后，黄帝命人给他戴上枷栲，在黎山之丘处死了他。这个地方后来被称作："解州"，解州产池盐，盐水是红色的，当地人说这是蚩尤的血化成的。对于跟随蚩尤叛乱的苗蛮九黎氏族，黄帝把其中愿意归顺的人们迁到邹屠之地，不愿意归顺的迁到有北之乡。
为了防止蚩尤死后作怪，黄帝命人把他的头埋在了东平寿张的阚地，坟高七丈，当地人每年十月祭祀的时候，都有赤气直冲天际，被称为"蚩尤旗"；把他的身体埋在泰山南面的矩野。蚩尤身上的枷栲，取下来后被抛掷在大荒之中的宋山上，后来化作一片枫树林。打败蚩尤之后，黄帝又派应龙杀死夸父。一时间蠢蠢欲动者闻风丧胆，无不归顺臣服，各部落一致承认黄帝取代炎帝神农氏，成为天下共主。
从此，天下有作乱者，黄帝就会亲自去征伐，平定之后再离开。黄帝还派人用蚩尤的画像昭示四方难以教化之地，告诫那里的部落不要忘记蚩尤作乱的教训。
黄帝为百姓披荆斩棘，开山通道，自己却没有过上一天安闲的日子。他的足迹东到渤海，登丸山和泰山，西边到崆峒，登鸡头山，南到长江，登上熊山、湘山，北边驱逐荤粥，与各部落首领在釜山合符。他在涿鹿的广平山下建立都邑，周围守卫着军队；用"云"来命名官员的职位，设五种官职分别管理天、地、神、祗和物类，使各司其序，不相混乱。军队称云师；设立左右大监，以监察数以万计的大小部落；亲自主持对鬼神山川的祭祀封禅之礼；立宝鼎，用蓍草推算历法，预测未来的节气朔望；任用风后、力牧、常先、大鸿等贤能之人治理国家；顺应天地四时的轮回，遵循阴阳五行的变化，服从生死存亡的道理。
黄帝和妻子嫘祖身体力行，带领百姓开垦田地，播种百谷草木，植桑养蚕，用德行教化天下，勤劳心力耳目，节用水火财物，使人民安居乐业。轩辕黄帝有"土德"之瑞，死的时候，大地都裂开了，人们把他安葬在桥山。黄帝生前，天下百姓都得其利；死后泽被万代，百年之内余威犹在，百年之外，人们还在遵从他的教导。
豢龙氏曰：
黄帝的有熊部落生活在姬水河流域，所以，黄帝"姬"姓，被称为"有熊氏"；由于黄帝居住在轩辕之丘，因此又被称为"轩辕氏"。在西汉司马迁的《史记》中则记载黄帝姓公孙，名轩辕。
虽然至今仍有冥顽不化之辈，比照西方的考古学否认"黄帝"的存在；但是，黄帝作为中华文明的基石而存在是谁也抹杀不了的。在上古的"三皇五帝"中，黄帝是第一个在正史上有明确记载的伟人。西汉-司马迁在其著作的《史记-五帝本纪》中，把黄帝作为开篇之作。中国有文字记载的五千年悠久历史也由此开端。
黄帝平定蚩尤的故事，是中国上古社会第一场惊天动地、鬼神助阵的战争。这场战事与人类最初的使用石制、木制等原始武器的混战不同，已经开始有了阵法、战术和节制，并且开始使用新式的武器和工具。
据《龙