“御医”的炫目光环，又治好了不少疑难杂症，就经常有人来找他求医问药，尤其是那些王公卿相自己或内眷有恙，不可能屈尊移步到李时珍的寓所，都是请他到府上诊脉，对他这样有本事的人也十分客气，少不了要跟他闲谈叙话、设宴款待。李时珍对此不胜其烦，却也有一耳朵没一耳朵地听说了不少官场奇闻轶事。高拱、俞大猷、戚继光等官场新贵的发迹始末自然是筵席之上议论的焦点，却是跟民间截然不同的另一种说法：高拱有个好恩师；戚继光有奉旨赴登州卫点验兵马的高拱的力荐；而俞大猷，则是到京城求官不得，在酒肆之中借酒浇愁，偶遇微服私访的皇上，一番风云际会，才在万千低级军官中脱颖而出……
这都是官场司空见惯之事，不足为奇。那些人在心中羡慕甚至嫉妒那几位官场新贵的狗屎运，表面上还得慨叹皇上知人善任、慧眼识英。受他们的影响，李时珍就更不相信什么神仙托梦、降世辅佐的鬼话了。
不过，海瑞能得到皇上的垂顾照拂，一直让李时珍甚为疑惑：琼州远在万里海外，皇上怎么就知道大明朝有他那么一个貌不惊人、学不出众的海南举子，还派自己的大伴、司礼监吕公公亲自到昭宁寺去见他，把他留在京城读书储才？莫非真有神仙托梦之说？
御前奏对，容不得他漫无边际地胡思乱想，李时珍赶紧收敛了心神，慌忙跪下应道：“皇上折杀微臣了……”
朱厚熜又把他搀扶了起来，笑着说：“想必你是不相信朕的话喽……”
质疑君父的话是大逆不道之罪；可若是说相信，岂不是承认自己千秋万代之后名声比皇上还要响亮？这更是大逆不道之罪！李时珍真不知道该怎么回话，十分尴尬的站在那里不敢应声。
“朕知道你不信那些怪力乱神之说，不过，你且要相信，朕所说的都是真的。只是我大明立国两百年，太医出了好几千位，民间良医也是人才辈出，可终归是要湮没在历史的长河之中，为什么朕唯独说你李时珍能名彪千古、万世流芳呢？正所谓天道酬勤，朕要让你去做一件旁人无法做到的事情。”
尽管是手无缚鸡之力的医生，听到皇上这么看重自己，李时珍心中不禁涌动出一股豪情：“恳请皇上明示，微臣赴汤蹈火，万死不辞！”
“哈哈哈！”朱厚熜大笑起来：“朕不过是让你给大同军、宣府军的医护兵办了三个月的培训班，你竟学得跟那些军中男儿一样豪气冲天了！看来，朕真该把我大明朝的翰林，甚至那些进士、举人、秀才都拉到军营里去军训三个月，让他们少一点酸腐之气，多一点男儿热血！”
说真的，提起这件事，李时珍至今仍是既感到不可思议，又无比感动——他办完了山东莱州的差事，回京被擢升为太医院院判，因在莱州之时曾感染瘟疫，九死一生总算是保住了性命，身体健康却受到极大的损伤，皇上特下恩旨，准他不必到衙门理事，一边静养，一边安心攻读医书钻研医术。吕芳悄悄找到他，让他给太子治病。那段时间，他每日悄然进宫为太子请脉，亲自煎汤熬药，还翻遍了古今医书，可谓是穷其所学，耗尽精力，却只能使太子的癫狂之症稍微缓解了一点，未能根治顽疾。圣驾回京之后，皇上不但没有怪罪于他，反而让他不必在太子身上耗费太多的精力和时间，命他抽调太医院太医为奉调进京整训的宣府、大同两军医护兵传授医术。一边是被视为国本的太子，一边是寻常兵将，皇上竟做出这样本末倒置的安排，以李时珍对皇上的崇敬，当然不会认为皇上淡漠天亲、冷落太子，而是认为皇上如天之仁，当真视天下臣民百姓都是自己的子民，有这样爱民如子的仁君，实乃百官万民之福……